wisegeneusa K003说明书
wisegeneusa的使命是开发，制造和提供新型基因组测序和检测技术的研究工具。我们将继续许可，开发和商业化表观遗传学中的新基因组测序试剂和方法。
5-羟甲基胞嘧啶是一种DNA甲基化修饰，由铁依赖性脱氧酶的Tet家族酶促氧化5-甲基胞嘧啶（5-mC）而发生
关于我们的TAB-seq套件，请注意以下事项。
TAB-seqβGT保护效率说明
关于我们的TAB-seq套件，请注意以下事项：
1.我们提供的5hmC加标对照通过使用5-羟甲基胞嘧啶dNTP混合物的PCR扩增产生。原则上，5hmC加标对照中的所有胞嘧啶应该是100％羟甲基化的。然而，由于商业化5hmdCTP的杂质和暴露于空气中5hmC的缓慢氧化，5hmC加标对照中每个胞嘧啶位点的实际5hmC丰度约为80％。结果，即使在标准亚硫酸氢盐测序中，5hmC加标对照中仅80％的胞嘧啶将被读作'C'。该数量（~80％）可能会根据5hmC加标控制的存储条件/时间而变化。
为了准确评估TAB-seq中5hmC的保护率，我们建议对含有相同批次的5hmC加标对照的一个样品进行标准亚硫酸氢盐测序，以确定其真正的5hmC丰度。例如，如果5hmC加标对照中80％的胞嘧啶在标准亚硫酸氢盐测序中读作'C'，其中70％在TAB-seq中读作'C'，则表明您的TAB-的实际保护率seq测定应为0.7 / 0.8 = 87.5％但不是70％。
2.在βGT保护后，当使用某种聚合酶（例如Taq聚合酶）时，5hmC对照上的浓密5gmC可能停止聚合。为了避免可能的PCR偏差，建议将PfuTurbo Cx hotstart聚合酶（Agilent）或等同物用于文库构建中的终PCR扩增步骤。
5mC Tet1氧化试剂盒
5mC Tet1 Oxidation
目录号：K003
单价：每件套669美元
产品说明
5mC Tet1氧化试剂盒可用于将基因组DNA中的5-甲基胞嘧啶（5mC）转化为5-羧基胞嘧啶（5caC）用于随后的测序应用。
每个试剂盒包含足够的试剂，可根据推荐的方案进行多达3个全基因组或9个基因座特异性测序反应。
存储
在抵达时在-80℃储存5mC Tet1氧化试剂盒。Tet1蛋白对温度敏感; 应避免多次冻融。
5hmC TAB-Seq Kit
Catalog No: K001
Unit Price: $969 / per kit
5hmC/5mC TAB-Array Kit (compatible to Infinium 450K Array)
Catalog No: K002
Unit Price: $869 / per kit
5mC Tet1 Oxidation Kit for the PacBio® RS Instrument
Catalog No: K004
Unit Price: $669 / per kit
5hmC DNA Standard
Catalog No: S002
Unit Price: $30 each
5mC DNA Standard
Catalog No: S001
Unit Price: $30 each
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